Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FlgP11088 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FlgP11088 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FlgP11088 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FlgP11088 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FlgP11088 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FlgP11088 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FlgP11088 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FlgP11088 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FlgP11088 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FlgP11088 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FlgP11088 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FlgP11088 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FlgP11088 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FlgP11088 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FlgP11088 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FlgP11088 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FlgP11088 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FlgP11088 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FlgP11088 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FlgP11088 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FlgP11088 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FlgP11088 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FlgP11088 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FlgP11088 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FlgP11088 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FlgP11088 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FlgP11088 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FlgP11088 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FlgP11088 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FlgP11088 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FlgP11088 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FlgP11088 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms