Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nup160Q9Z0W3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Nup160Q9Z0W3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nup160Q9Z0W3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms