Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 RIP1YEL024W 648 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YHR022CYHR022C 771 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YIL025CYIL025C 375 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 GMH1YKR030W 822 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 PCL1YNL289W 840 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YOR338WYOR338W 1092 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 UMP1YBR173C 447 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ALR2YFL050C 2577 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MGR3YMR115W 1506 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ALG6YOR002W 1635 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 IMA3YIL172C 1770 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 IMA4YJL221C 1770 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RRP8YDR083W 1179 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ARG82YDR173C 1068 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RPL34AYER056C-A 366 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YFL068WYFL068W 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MRP4YHL004W 1185 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 PPE1YHR075C 1203 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 HTA2YBL003C 399 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RPN8YOR261C 1017 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 snR19snR19 568 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 GIP4YAL031C 2283 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 LAS21YJL062W 2493 nt4.35□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 SIP1YDR422C 2448 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YDL186WYDL186W 834 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 SHU2YDR078C 672 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 COS12YGL263W 1143 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 COA3YJL062W-A 258 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YLR042CYLR042C 486 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 NMA1YLR328W 1206 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 UAF30YOR295W 687 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 POC4YPL144W 447 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RTC1YOL138C 4026 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 CTK1YKL139W 1587 nt4.34□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 HOT1YMR172W 2160 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 GSY1YFR015C 2127 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 PTR3YFR029W 2037 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 SAT4YCR008W 1812 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 TED1YIL039W 1422 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 NBP2YDR162C 711 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YHR112CYHR112C 1137 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YJL220WYJL220W 453 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YUH1YJR099W 711 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 AAD10YJR155W 867 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 SIC1YLR079W 855 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 VAM3YOR106W 852 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YPR142CYPR142C 564 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt4.33□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 CTR86YCR054C 1692 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 SPS2YDR522C 1509 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 THS1YIL078W 2205 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 MTD1YKR080W 963 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YIM1YMR152W 1098 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 EOS1YNL080C 1101 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 CYC2YOR037W 1101 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YER158CYER158C 1722 nt4.32□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 RRP14YKL082C 1305 nt4.31□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YCL076WYCL076W 744 nt4.31□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 RNH202YDR279W 1053 nt4.31□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 PRE9YGR135W 777 nt4.31□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YGR168CYGR168C 1131 nt4.31□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.31□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.31□□□□□ -1.72
NMD4Q12129 ATG16YMR159C 453 nt4.31□□□□□ -1.72
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