Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms