Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RptnP97347 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RptnP97347 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RptnP97347 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RptnP97347 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RptnP97347 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RptnP97347 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RptnP97347 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RptnP97347 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RptnP97347 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RptnP97347 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RptnP97347 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms