Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx6Q9ER75 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Irx6Q9ER75 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms