Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 URA7YBL039C 1740 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 TRP3YKL211C 1455 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 snR7-LsnR7-L 214 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 MIX14YDR031W 366 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 DON1YDR273W 1098 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RPL22BYFL034C-A 369 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YGL082WYGL082W 1146 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 PRS3YHL011C 963 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 STE18YJR086W 333 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 COX17YLL009C 210 nt5.8□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 SEN34YAR008W 828 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 BUR2YLR226W 1188 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YLR257WYLR257W 966 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 PGA3YML125C 939 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SNO1YMR095C 675 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YNL046WYNL046W 519 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SPS19YNL202W 879 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RDI1YDL135C 609 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YHR180WYHR180W 492 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 GAT3YLR013W 426 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YLR124WYLR124W 345 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 MAP1YLR244C 1164 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 CDC73YLR418C 1182 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 HOR7YMR251W-A 180 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 MDJ2YNL328C 441 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SGT1YOR057W 1188 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 ADE13YLR359W 1449 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SRV2YNL138W 1581 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 UGO1YDR470C 1509 nt5.79□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 VBA1YMR088C 1689 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RNR3YIL066C 2610 nt5.78□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 VCX1YDL128W 1236 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YDL144CYDL144C 1071 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 PET100YDR079W 336 nt5.78□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 SOL3YHR163W 750 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YJL114WYJL114W 681 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RLP24YLR009W 600 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YAR030CYAR030C 342 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SFH1YLR321C 1281 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RRG9YNL213C 645 nt5.78□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 RER2YBR002C 861 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 snR11snR11 258 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 IRC13YOR235W 315 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SCT1YBL011W 2280 nt5.78□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 UTP7YER082C 1665 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RPT2YDL007W 1314 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 VTH1YIL173W 4650 nt5.77□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 VTH2YJL222W 4650 nt5.77□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 YDR056CYDR056C 618 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 UBC6YER100W 753 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 LYS5YGL154C 819 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YGR079WYGR079W 1113 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YKL162CYKL162C 1209 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 IRC19YLL033W 693 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 DYN3YMR299C 939 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 MRPL22YNL177C 930 nt5.77□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 PLP2YOR281C 861 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YPR098CYPR098C 486 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 snR44snR44 211 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 TNA1YGR260W 1605 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 ACC1YNR016C 6702 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 QRI1YDL103C 1434 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 CTH1YDR151C 978 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YER134CYER134C 537 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 NPY1YGL067W 1155 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 MRPS35YGR165W 1038 nt5.76□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 CBP4YGR174C 513 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SNX4YJL036W 1272 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 POM33YLL023C 840 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 POR1YNL055C 852 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YNL058CYNL058C 951 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 TYE7YOR344C 876 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YPL073CYPL073C 486 nt5.76□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPR195CYPR195C 330 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 CCZ1YBR131W 2115 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 MCM6YGL201C 3054 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SHE10YGL228W 1734 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 EPS1YIL005W 2106 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YDR018CYDR018C 1191 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 COX26YDR119W-A 201 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 ARF3YOR094W 552 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 ARR3YPR201W 1215 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 PDB1YBR221C 1101 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SLD2YKL108W 1362 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SPT14YPL175W 1359 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SIP5YMR140W 1470 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SFB3YHR098C 2790 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SLC1YDL052C 912 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 DOS2YDR068W 933 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 TAF10YDR167W 621 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 HSP42YDR171W 1128 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SRB7YDR308C 423 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YGL159WYGL159W 1113 nt5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.5 ms