Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pf4Q9Z126 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pf4Q9Z126 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.8 ms