Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87499Q3UX49 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87499Q3UX49 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms