Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epb41P48193 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epb41P48193 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epb41P48193 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb41P48193 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb41P48193 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms