Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 DDI2YFL061W 678 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 KEG1YFR042W 603 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 YHB1YGR234W 1200 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 CAB4YGR277C 918 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 LNP1YHR192W 837 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 DDI3YNL335W 678 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 SWI3YJL176C 2478 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 NUP116YMR047C 3342 nt4.97□□□□□ -1.61
VFA1P40080 YMR1YJR110W 2067 nt4.96□□□□□ -1.61
VFA1P40080 SAP4YGL229C 2457 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 FBP26YJL155C 1359 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YFL068WYFL068W 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 SDT1YGL224C 843 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 PAN5YHR063C 1140 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 HYM1YKL189W 1200 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 PDX3YBR035C 687 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 RGP1YDR137W 1992 nt4.96□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MDM10YAL010C 1482 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YDL027CYDL027C 1263 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 SHR3YDL212W 633 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 SNA2YDR525W-A 240 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 TTI2YJR136C 1266 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 GMH1YKR030W 822 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MRPL39YML009C 213 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 SAP30YMR263W 606 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 BUD17YNR027W 954 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YHR182WYHR182W 2358 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 DNF2YDR093W 4839 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YNL095CYNL095C 1929 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 PAN1YIR006C 4443 nt4.95□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YER158CYER158C 1722 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 CBF5YLR175W 1452 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 RIP1YEL024W 648 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 NPY1YGL067W 1155 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 NAT2YGR147C 867 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 GPP1YIL053W 753 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 RPF2YKR081C 1035 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 NMA1YLR328W 1206 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YLR462WYLR462W 609 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YIM1YMR152W 1098 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 SSU72YNL222W 621 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 snR19snR19 568 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 GAS5YOL030W 1455 nt4.94□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MGR3YMR115W 1506 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 PRP9YDL030W 1593 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MSS2YDL107W 1056 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 ARG82YDR173C 1068 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YGR079WYGR079W 1113 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MRPS35YGR165W 1038 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 AIM23YJL131C 1071 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 TPP1YMR156C 717 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 ATG16YMR159C 453 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 IAH1YOR126C 717 nt4.93□□□□□ -1.62
VFA1P40080 TYR1YBR166C 1359 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 ERG4YGL012W 1422 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MPS2YGL075C 1164 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 ARG3YJL088W 1017 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 RFC2YJR068W 1062 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 PNP1YLR209C 936 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MED7YOL135C 669 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YBR219CYBR219C 384 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MSC2YDR205W 2175 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 PDR15YDR406W 4590 nt4.92□□□□□ -1.62
VFA1P40080 MCX1YBR227C 1563 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 ALG6YOR002W 1635 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 ARF2YDL137W 546 nt4.91□□□□□ -1.62
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