Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESR1P03372 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESR1P03372 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESR1P03372 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESR1P03372 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ESR1P03372 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESR1P03372 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESR1P03372 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESR1P03372 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESR1P03372 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESR1P03372 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ESR1P03372 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESR1P03372 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESR1P03372 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESR1P03372 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESR1P03372 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ESR1P03372 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ESR1P03372 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ESR1P03372 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESR1P03372 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms