Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Gm20828J3KMI7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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