Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP5

Cdh22, Cadherin-22, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh22Q9WTP5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdh22Q9WTP5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh22Q9WTP5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh22Q9WTP5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh22Q9WTP5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdh22Q9WTP5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdh22Q9WTP5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdh22Q9WTP5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh22Q9WTP5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh22Q9WTP5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh22Q9WTP5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh22Q9WTP5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh22Q9WTP5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh22Q9WTP5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh22Q9WTP5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdh22Q9WTP5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdh22Q9WTP5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh22Q9WTP5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh22Q9WTP5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh22Q9WTP5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh22Q9WTP5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh22Q9WTP5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh22Q9WTP5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh22Q9WTP5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh22Q9WTP5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh22Q9WTP5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh22Q9WTP5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh22Q9WTP5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdh22Q9WTP5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdh22Q9WTP5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdh22Q9WTP5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdh22Q9WTP5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh22Q9WTP5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh22Q9WTP5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh22Q9WTP5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh22Q9WTP5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh22Q9WTP5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh22Q9WTP5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh22Q9WTP5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms