Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Copg1Q9QZE5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Copg1Q9QZE5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Copg1Q9QZE5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Copg1Q9QZE5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Copg1Q9QZE5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copg1Q9QZE5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copg1Q9QZE5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copg1Q9QZE5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Copg1Q9QZE5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Copg1Q9QZE5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Copg1Q9QZE5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Copg1Q9QZE5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Copg1Q9QZE5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Copg1Q9QZE5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Copg1Q9QZE5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Copg1Q9QZE5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Copg1Q9QZE5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Copg1Q9QZE5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Copg1Q9QZE5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Copg1Q9QZE5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Copg1Q9QZE5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Copg1Q9QZE5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copg1Q9QZE5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copg1Q9QZE5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Copg1Q9QZE5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Copg1Q9QZE5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Copg1Q9QZE5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copg1Q9QZE5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Copg1Q9QZE5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copg1Q9QZE5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Copg1Q9QZE5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Copg1Q9QZE5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copg1Q9QZE5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Copg1Q9QZE5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Copg1Q9QZE5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copg1Q9QZE5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copg1Q9QZE5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copg1Q9QZE5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copg1Q9QZE5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copg1Q9QZE5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copg1Q9QZE5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms