Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Copg1Q9QZE5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Copg1Q9QZE5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Copg1Q9QZE5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Copg1Q9QZE5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Copg1Q9QZE5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Copg1Q9QZE5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Copg1Q9QZE5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Copg1Q9QZE5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Copg1Q9QZE5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Copg1Q9QZE5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Copg1Q9QZE5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Copg1Q9QZE5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Copg1Q9QZE5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Copg1Q9QZE5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Copg1Q9QZE5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Copg1Q9QZE5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Copg1Q9QZE5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Copg1Q9QZE5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Copg1Q9QZE5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Copg1Q9QZE5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Copg1Q9QZE5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Copg1Q9QZE5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Copg1Q9QZE5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Copg1Q9QZE5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Copg1Q9QZE5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Copg1Q9QZE5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Copg1Q9QZE5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Copg1Q9QZE5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Copg1Q9QZE5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Copg1Q9QZE5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Copg1Q9QZE5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Copg1Q9QZE5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Copg1Q9QZE5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Copg1Q9QZE5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Copg1Q9QZE5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Copg1Q9QZE5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Copg1Q9QZE5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Copg1Q9QZE5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Copg1Q9QZE5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Copg1Q9QZE5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Copg1Q9QZE5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Copg1Q9QZE5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Copg1Q9QZE5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Copg1Q9QZE5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Copg1Q9QZE5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Copg1Q9QZE5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Copg1Q9QZE5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Copg1Q9QZE5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Copg1Q9QZE5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Copg1Q9QZE5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Copg1Q9QZE5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Copg1Q9QZE5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Copg1Q9QZE5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Copg1Q9QZE5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Copg1Q9QZE5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Copg1Q9QZE5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Copg1Q9QZE5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Copg1Q9QZE5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Copg1Q9QZE5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Copg1Q9QZE5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Copg1Q9QZE5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Copg1Q9QZE5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Copg1Q9QZE5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Copg1Q9QZE5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Copg1Q9QZE5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Copg1Q9QZE5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Copg1Q9QZE5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Copg1Q9QZE5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Copg1Q9QZE5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Copg1Q9QZE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Copg1Q9QZE5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Copg1Q9QZE5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Copg1Q9QZE5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Copg1Q9QZE5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Copg1Q9QZE5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Copg1Q9QZE5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Copg1Q9QZE5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Copg1Q9QZE5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Copg1Q9QZE5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Copg1Q9QZE5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Copg1Q9QZE5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Copg1Q9QZE5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Copg1Q9QZE5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Copg1Q9QZE5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Copg1Q9QZE5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Copg1Q9QZE5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Copg1Q9QZE5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Copg1Q9QZE5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Copg1Q9QZE5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Copg1Q9QZE5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Copg1Q9QZE5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Copg1Q9QZE5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Copg1Q9QZE5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Copg1Q9QZE5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Copg1Q9QZE5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Copg1Q9QZE5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Copg1Q9QZE5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Copg1Q9QZE5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Copg1Q9QZE5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms