Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Apbb1Q9QXJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Apbb1Q9QXJ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Apbb1Q9QXJ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Apbb1Q9QXJ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Apbb1Q9QXJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Apbb1Q9QXJ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Apbb1Q9QXJ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Apbb1Q9QXJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Apbb1Q9QXJ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Apbb1Q9QXJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Apbb1Q9QXJ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Apbb1Q9QXJ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Apbb1Q9QXJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Apbb1Q9QXJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Apbb1Q9QXJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Apbb1Q9QXJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Apbb1Q9QXJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Apbb1Q9QXJ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Apbb1Q9QXJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Apbb1Q9QXJ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Apbb1Q9QXJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Apbb1Q9QXJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Apbb1Q9QXJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Apbb1Q9QXJ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Apbb1Q9QXJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Apbb1Q9QXJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Apbb1Q9QXJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Apbb1Q9QXJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Apbb1Q9QXJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Apbb1Q9QXJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Apbb1Q9QXJ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Apbb1Q9QXJ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Apbb1Q9QXJ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Apbb1Q9QXJ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Apbb1Q9QXJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Apbb1Q9QXJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Apbb1Q9QXJ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Apbb1Q9QXJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Apbb1Q9QXJ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Apbb1Q9QXJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Apbb1Q9QXJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Apbb1Q9QXJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Apbb1Q9QXJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Apbb1Q9QXJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Apbb1Q9QXJ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Apbb1Q9QXJ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Apbb1Q9QXJ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Apbb1Q9QXJ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Apbb1Q9QXJ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Apbb1Q9QXJ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Apbb1Q9QXJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Apbb1Q9QXJ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Apbb1Q9QXJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Apbb1Q9QXJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Apbb1Q9QXJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Apbb1Q9QXJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Apbb1Q9QXJ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Apbb1Q9QXJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Apbb1Q9QXJ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Apbb1Q9QXJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Apbb1Q9QXJ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Apbb1Q9QXJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Apbb1Q9QXJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Apbb1Q9QXJ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Apbb1Q9QXJ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Apbb1Q9QXJ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Apbb1Q9QXJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Apbb1Q9QXJ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Apbb1Q9QXJ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms