Protein–RNA interactions for Protein: Q9D486

Cmip, C-Maf-inducing protein, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CmipQ9D486 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CmipQ9D486 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CmipQ9D486 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CmipQ9D486 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CmipQ9D486 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CmipQ9D486 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CmipQ9D486 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CmipQ9D486 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CmipQ9D486 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CmipQ9D486 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CmipQ9D486 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CmipQ9D486 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CmipQ9D486 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CmipQ9D486 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CmipQ9D486 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CmipQ9D486 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CmipQ9D486 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CmipQ9D486 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CmipQ9D486 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CmipQ9D486 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CmipQ9D486 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CmipQ9D486 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CmipQ9D486 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CmipQ9D486 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CmipQ9D486 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CmipQ9D486 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CmipQ9D486 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CmipQ9D486 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CmipQ9D486 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms