Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atl3Q91YH5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atl3Q91YH5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Atl3Q91YH5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atl3Q91YH5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Atl3Q91YH5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atl3Q91YH5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atl3Q91YH5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atl3Q91YH5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Atl3Q91YH5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atl3Q91YH5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atl3Q91YH5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atl3Q91YH5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atl3Q91YH5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atl3Q91YH5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atl3Q91YH5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atl3Q91YH5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atl3Q91YH5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atl3Q91YH5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atl3Q91YH5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atl3Q91YH5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Atl3Q91YH5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atl3Q91YH5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atl3Q91YH5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Atl3Q91YH5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atl3Q91YH5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atl3Q91YH5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atl3Q91YH5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atl3Q91YH5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Atl3Q91YH5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atl3Q91YH5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Atl3Q91YH5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atl3Q91YH5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Atl3Q91YH5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atl3Q91YH5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atl3Q91YH5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Atl3Q91YH5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Atl3Q91YH5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atl3Q91YH5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Atl3Q91YH5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Atl3Q91YH5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Atl3Q91YH5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Atl3Q91YH5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atl3Q91YH5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atl3Q91YH5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atl3Q91YH5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atl3Q91YH5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Atl3Q91YH5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atl3Q91YH5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Atl3Q91YH5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atl3Q91YH5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atl3Q91YH5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atl3Q91YH5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atl3Q91YH5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Atl3Q91YH5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atl3Q91YH5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atl3Q91YH5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atl3Q91YH5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atl3Q91YH5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atl3Q91YH5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atl3Q91YH5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atl3Q91YH5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms