Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
4932414N04RikQ8CEQ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4932414N04RikQ8CEQ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4932414N04RikQ8CEQ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4932414N04RikQ8CEQ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
4932414N04RikQ8CEQ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4932414N04RikQ8CEQ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4932414N04RikQ8CEQ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4932414N04RikQ8CEQ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4932414N04RikQ8CEQ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4932414N04RikQ8CEQ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4932414N04RikQ8CEQ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4932414N04RikQ8CEQ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4932414N04RikQ8CEQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4932414N04RikQ8CEQ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4932414N04RikQ8CEQ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4932414N04RikQ8CEQ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
4932414N04RikQ8CEQ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4932414N04RikQ8CEQ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4932414N04RikQ8CEQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4932414N04RikQ8CEQ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4932414N04RikQ8CEQ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4932414N04RikQ8CEQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4932414N04RikQ8CEQ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4932414N04RikQ8CEQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4932414N04RikQ8CEQ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4932414N04RikQ8CEQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4932414N04RikQ8CEQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4932414N04RikQ8CEQ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4932414N04RikQ8CEQ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4932414N04RikQ8CEQ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4932414N04RikQ8CEQ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4932414N04RikQ8CEQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4932414N04RikQ8CEQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 523.4 ms