Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUD0

Gpr4, G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr4Q8BUD0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr4Q8BUD0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpr4Q8BUD0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpr4Q8BUD0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpr4Q8BUD0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpr4Q8BUD0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpr4Q8BUD0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr4Q8BUD0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpr4Q8BUD0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr4Q8BUD0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpr4Q8BUD0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr4Q8BUD0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr4Q8BUD0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gpr4Q8BUD0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpr4Q8BUD0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpr4Q8BUD0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr4Q8BUD0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr4Q8BUD0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr4Q8BUD0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr4Q8BUD0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr4Q8BUD0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr4Q8BUD0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms