Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clec18aQ7TSQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Clec18aQ7TSQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clec18aQ7TSQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clec18aQ7TSQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clec18aQ7TSQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clec18aQ7TSQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clec18aQ7TSQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clec18aQ7TSQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Clec18aQ7TSQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clec18aQ7TSQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clec18aQ7TSQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clec18aQ7TSQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clec18aQ7TSQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clec18aQ7TSQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clec18aQ7TSQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clec18aQ7TSQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec18aQ7TSQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec18aQ7TSQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec18aQ7TSQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec18aQ7TSQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clec18aQ7TSQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec18aQ7TSQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec18aQ7TSQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec18aQ7TSQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec18aQ7TSQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec18aQ7TSQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clec18aQ7TSQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clec18aQ7TSQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec18aQ7TSQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec18aQ7TSQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec18aQ7TSQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec18aQ7TSQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec18aQ7TSQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec18aQ7TSQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec18aQ7TSQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec18aQ7TSQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec18aQ7TSQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec18aQ7TSQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec18aQ7TSQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec18aQ7TSQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms