Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Clec18aQ7TSQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Clec18aQ7TSQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Clec18aQ7TSQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clec18aQ7TSQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Clec18aQ7TSQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Clec18aQ7TSQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clec18aQ7TSQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clec18aQ7TSQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Clec18aQ7TSQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Clec18aQ7TSQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clec18aQ7TSQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Clec18aQ7TSQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Clec18aQ7TSQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Clec18aQ7TSQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clec18aQ7TSQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Clec18aQ7TSQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Clec18aQ7TSQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clec18aQ7TSQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Clec18aQ7TSQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Clec18aQ7TSQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clec18aQ7TSQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clec18aQ7TSQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clec18aQ7TSQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clec18aQ7TSQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clec18aQ7TSQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clec18aQ7TSQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Clec18aQ7TSQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clec18aQ7TSQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Clec18aQ7TSQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Clec18aQ7TSQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clec18aQ7TSQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clec18aQ7TSQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clec18aQ7TSQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clec18aQ7TSQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clec18aQ7TSQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clec18aQ7TSQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clec18aQ7TSQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Clec18aQ7TSQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clec18aQ7TSQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clec18aQ7TSQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clec18aQ7TSQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clec18aQ7TSQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Clec18aQ7TSQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clec18aQ7TSQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clec18aQ7TSQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clec18aQ7TSQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clec18aQ7TSQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clec18aQ7TSQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Clec18aQ7TSQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec18aQ7TSQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clec18aQ7TSQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clec18aQ7TSQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clec18aQ7TSQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clec18aQ7TSQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clec18aQ7TSQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clec18aQ7TSQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clec18aQ7TSQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clec18aQ7TSQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Clec18aQ7TSQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Clec18aQ7TSQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clec18aQ7TSQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clec18aQ7TSQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clec18aQ7TSQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clec18aQ7TSQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clec18aQ7TSQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clec18aQ7TSQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Clec18aQ7TSQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clec18aQ7TSQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Clec18aQ7TSQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clec18aQ7TSQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clec18aQ7TSQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clec18aQ7TSQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clec18aQ7TSQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec18aQ7TSQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clec18aQ7TSQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clec18aQ7TSQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clec18aQ7TSQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clec18aQ7TSQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clec18aQ7TSQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clec18aQ7TSQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clec18aQ7TSQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clec18aQ7TSQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clec18aQ7TSQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms