Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nemp1Q6ZQE4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nemp1Q6ZQE4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nemp1Q6ZQE4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nemp1Q6ZQE4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nemp1Q6ZQE4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nemp1Q6ZQE4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nemp1Q6ZQE4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nemp1Q6ZQE4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nemp1Q6ZQE4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nemp1Q6ZQE4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nemp1Q6ZQE4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nemp1Q6ZQE4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nemp1Q6ZQE4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nemp1Q6ZQE4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nemp1Q6ZQE4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nemp1Q6ZQE4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nemp1Q6ZQE4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nemp1Q6ZQE4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nemp1Q6ZQE4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Nemp1Q6ZQE4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nemp1Q6ZQE4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nemp1Q6ZQE4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nemp1Q6ZQE4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nemp1Q6ZQE4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nemp1Q6ZQE4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nemp1Q6ZQE4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nemp1Q6ZQE4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nemp1Q6ZQE4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nemp1Q6ZQE4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nemp1Q6ZQE4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nemp1Q6ZQE4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nemp1Q6ZQE4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nemp1Q6ZQE4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nemp1Q6ZQE4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nemp1Q6ZQE4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nemp1Q6ZQE4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nemp1Q6ZQE4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nemp1Q6ZQE4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nemp1Q6ZQE4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nemp1Q6ZQE4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nemp1Q6ZQE4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nemp1Q6ZQE4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nemp1Q6ZQE4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nemp1Q6ZQE4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nemp1Q6ZQE4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nemp1Q6ZQE4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nemp1Q6ZQE4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nemp1Q6ZQE4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nemp1Q6ZQE4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nemp1Q6ZQE4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nemp1Q6ZQE4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nemp1Q6ZQE4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms