Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Neurod1Q60867 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Neurod1Q60867 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Neurod1Q60867 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Neurod1Q60867 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Neurod1Q60867 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Neurod1Q60867 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Neurod1Q60867 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Neurod1Q60867 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Neurod1Q60867 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Neurod1Q60867 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Neurod1Q60867 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Neurod1Q60867 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Neurod1Q60867 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Neurod1Q60867 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Neurod1Q60867 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Neurod1Q60867 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Neurod1Q60867 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Neurod1Q60867 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Neurod1Q60867 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Neurod1Q60867 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Neurod1Q60867 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Neurod1Q60867 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Neurod1Q60867 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Neurod1Q60867 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Neurod1Q60867 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Neurod1Q60867 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Neurod1Q60867 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Neurod1Q60867 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Neurod1Q60867 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Neurod1Q60867 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Neurod1Q60867 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Neurod1Q60867 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Neurod1Q60867 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Neurod1Q60867 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Neurod1Q60867 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Neurod1Q60867 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Neurod1Q60867 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Neurod1Q60867 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Neurod1Q60867 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Neurod1Q60867 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Neurod1Q60867 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Neurod1Q60867 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Neurod1Q60867 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Neurod1Q60867 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Neurod1Q60867 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Neurod1Q60867 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Neurod1Q60867 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Neurod1Q60867 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Neurod1Q60867 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Neurod1Q60867 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Neurod1Q60867 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Neurod1Q60867 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Neurod1Q60867 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Neurod1Q60867 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Neurod1Q60867 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Neurod1Q60867 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Neurod1Q60867 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Neurod1Q60867 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Neurod1Q60867 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Neurod1Q60867 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Neurod1Q60867 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Neurod1Q60867 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Neurod1Q60867 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Neurod1Q60867 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Neurod1Q60867 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Neurod1Q60867 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Neurod1Q60867 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Neurod1Q60867 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Neurod1Q60867 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Neurod1Q60867 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Neurod1Q60867 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Neurod1Q60867 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Neurod1Q60867 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Neurod1Q60867 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Neurod1Q60867 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Neurod1Q60867 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms