Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Neurod1Q60867 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Neurod1Q60867 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Neurod1Q60867 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Neurod1Q60867 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Neurod1Q60867 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Neurod1Q60867 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Neurod1Q60867 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Neurod1Q60867 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Neurod1Q60867 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Neurod1Q60867 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
Neurod1Q60867 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Neurod1Q60867 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Neurod1Q60867 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Neurod1Q60867 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Neurod1Q60867 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Neurod1Q60867 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Neurod1Q60867 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Neurod1Q60867 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Neurod1Q60867 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Neurod1Q60867 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Neurod1Q60867 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Neurod1Q60867 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Neurod1Q60867 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Neurod1Q60867 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Neurod1Q60867 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Neurod1Q60867 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Neurod1Q60867 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Neurod1Q60867 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Neurod1Q60867 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Neurod1Q60867 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Neurod1Q60867 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Neurod1Q60867 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Neurod1Q60867 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Neurod1Q60867 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Neurod1Q60867 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Neurod1Q60867 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Neurod1Q60867 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Neurod1Q60867 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Neurod1Q60867 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Neurod1Q60867 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Neurod1Q60867 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Neurod1Q60867 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Neurod1Q60867 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Neurod1Q60867 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Neurod1Q60867 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Neurod1Q60867 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Neurod1Q60867 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Neurod1Q60867 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Neurod1Q60867 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Neurod1Q60867 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Neurod1Q60867 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Neurod1Q60867 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Neurod1Q60867 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Neurod1Q60867 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Neurod1Q60867 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Neurod1Q60867 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Neurod1Q60867 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Neurod1Q60867 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Neurod1Q60867 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Neurod1Q60867 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Neurod1Q60867 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Neurod1Q60867 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Neurod1Q60867 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Neurod1Q60867 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Neurod1Q60867 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Neurod1Q60867 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Neurod1Q60867 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Neurod1Q60867 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Neurod1Q60867 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Neurod1Q60867 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Neurod1Q60867 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Neurod1Q60867 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Neurod1Q60867 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Neurod1Q60867 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Neurod1Q60867 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Neurod1Q60867 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Neurod1Q60867 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Neurod1Q60867 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Neurod1Q60867 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Neurod1Q60867 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Neurod1Q60867 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Neurod1Q60867 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Neurod1Q60867 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Neurod1Q60867 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Neurod1Q60867 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Neurod1Q60867 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Neurod1Q60867 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Neurod1Q60867 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Neurod1Q60867 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Neurod1Q60867 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Neurod1Q60867 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Neurod1Q60867 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Neurod1Q60867 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Neurod1Q60867 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Neurod1Q60867 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Neurod1Q60867 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Neurod1Q60867 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Neurod1Q60867 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Neurod1Q60867 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms