Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkaa1Q5EG47 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkaa1Q5EG47 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prkaa1Q5EG47 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Prkaa1Q5EG47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkaa1Q5EG47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkaa1Q5EG47 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkaa1Q5EG47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkaa1Q5EG47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkaa1Q5EG47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkaa1Q5EG47 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkaa1Q5EG47 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkaa1Q5EG47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prkaa1Q5EG47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkaa1Q5EG47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkaa1Q5EG47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkaa1Q5EG47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkaa1Q5EG47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkaa1Q5EG47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkaa1Q5EG47 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prkaa1Q5EG47 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkaa1Q5EG47 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkaa1Q5EG47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkaa1Q5EG47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkaa1Q5EG47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkaa1Q5EG47 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkaa1Q5EG47 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkaa1Q5EG47 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkaa1Q5EG47 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkaa1Q5EG47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkaa1Q5EG47 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms