Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q504N7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q504N7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q504N7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q504N7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q504N7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q504N7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q504N7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q504N7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q504N7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q504N7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q504N7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q504N7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q504N7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q504N7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q504N7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q504N7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q504N7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q504N7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q504N7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q504N7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q504N7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q504N7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q504N7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q504N7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q504N7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q504N7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q504N7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q504N7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q504N7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q504N7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q504N7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q504N7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q504N7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q504N7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q504N7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q504N7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q504N7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q504N7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q504N7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q504N7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q504N7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q504N7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q504N7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q504N7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q504N7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q504N7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q504N7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q504N7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q504N7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q504N7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q504N7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q504N7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q504N7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q504N7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q504N7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q504N7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q504N7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q504N7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q504N7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q504N7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q504N7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q504N7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q504N7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q504N7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q504N7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q504N7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q504N7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q504N7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q504N7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q504N7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q504N7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q504N7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q504N7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q504N7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q504N7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q504N7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q504N7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q504N7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q504N7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q504N7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q504N7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q504N7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q504N7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q504N7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q504N7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q504N7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q504N7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q504N7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q504N7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q504N7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q504N7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q504N7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q504N7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q504N7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q504N7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q504N7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q504N7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q504N7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q504N7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms