Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Q504N7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q504N7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q504N7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q504N7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Q504N7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Q504N7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Q504N7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Q504N7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Q504N7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q504N7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Q504N7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q504N7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q504N7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q504N7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Q504N7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q504N7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q504N7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q504N7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q504N7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Q504N7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q504N7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q504N7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q504N7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q504N7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q504N7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q504N7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q504N7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q504N7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Q504N7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q504N7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q504N7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q504N7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q504N7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q504N7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q504N7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q504N7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q504N7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q504N7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q504N7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q504N7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q504N7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q504N7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q504N7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q504N7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q504N7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q504N7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q504N7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q504N7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q504N7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q504N7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q504N7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q504N7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q504N7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q504N7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q504N7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q504N7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q504N7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q504N7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q504N7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q504N7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q504N7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q504N7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q504N7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q504N7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q504N7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q504N7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q504N7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q504N7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q504N7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q504N7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q504N7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q504N7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q504N7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q504N7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q504N7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q504N7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q504N7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q504N7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q504N7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q504N7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q504N7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q504N7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q504N7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q504N7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q504N7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q504N7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q504N7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q504N7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q504N7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q504N7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q504N7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q504N7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q504N7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q504N7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q504N7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q504N7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q504N7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q504N7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q504N7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms