Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CrxosQ3UL53 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrxosQ3UL53 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CrxosQ3UL53 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CrxosQ3UL53 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CrxosQ3UL53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CrxosQ3UL53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CrxosQ3UL53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrxosQ3UL53 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CrxosQ3UL53 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CrxosQ3UL53 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CrxosQ3UL53 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CrxosQ3UL53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CrxosQ3UL53 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CrxosQ3UL53 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CrxosQ3UL53 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrxosQ3UL53 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CrxosQ3UL53 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrxosQ3UL53 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CrxosQ3UL53 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrxosQ3UL53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrxosQ3UL53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrxosQ3UL53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CrxosQ3UL53 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrxosQ3UL53 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrxosQ3UL53 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrxosQ3UL53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrxosQ3UL53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CrxosQ3UL53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrxosQ3UL53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrxosQ3UL53 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrxosQ3UL53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrxosQ3UL53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrxosQ3UL53 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CrxosQ3UL53 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrxosQ3UL53 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms