Protein–RNA interactions for Protein: Q149M0

Clec12b, C-type lectin domain family 12 member B, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec12bQ149M0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec12bQ149M0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec12bQ149M0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec12bQ149M0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec12bQ149M0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec12bQ149M0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec12bQ149M0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec12bQ149M0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec12bQ149M0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clec12bQ149M0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec12bQ149M0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec12bQ149M0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec12bQ149M0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec12bQ149M0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec12bQ149M0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec12bQ149M0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec12bQ149M0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec12bQ149M0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec12bQ149M0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec12bQ149M0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec12bQ149M0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec12bQ149M0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec12bQ149M0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec12bQ149M0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms