Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8a1Q00558 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8a1Q00558 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
F8a1Q00558 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8a1Q00558 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F8a1Q00558 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8a1Q00558 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8a1Q00558 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8a1Q00558 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8a1Q00558 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8a1Q00558 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8a1Q00558 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8a1Q00558 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
F8a1Q00558 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8a1Q00558 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8a1Q00558 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
F8a1Q00558 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8a1Q00558 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8a1Q00558 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8a1Q00558 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8a1Q00558 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8a1Q00558 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8a1Q00558 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8a1Q00558 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8a1Q00558 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8a1Q00558 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8a1Q00558 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8a1Q00558 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8a1Q00558 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8a1Q00558 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8a1Q00558 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8a1Q00558 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
F8a1Q00558 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8a1Q00558 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8a1Q00558 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
F8a1Q00558 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F8a1Q00558 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
F8a1Q00558 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F8a1Q00558 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F8a1Q00558 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F8a1Q00558 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
F8a1Q00558 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F8a1Q00558 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F8a1Q00558 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F8a1Q00558 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
F8a1Q00558 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F8a1Q00558 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F8a1Q00558 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
F8a1Q00558 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8a1Q00558 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8a1Q00558 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms