Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Casp4P70343 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp4P70343 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp4P70343 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp4P70343 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Casp4P70343 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casp4P70343 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casp4P70343 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Casp4P70343 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Casp4P70343 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp4P70343 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp4P70343 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Casp4P70343 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casp4P70343 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casp4P70343 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Casp4P70343 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Casp4P70343 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Casp4P70343 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casp4P70343 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casp4P70343 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casp4P70343 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Casp4P70343 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casp4P70343 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casp4P70343 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp4P70343 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp4P70343 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp4P70343 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp4P70343 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp4P70343 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp4P70343 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casp4P70343 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casp4P70343 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp4P70343 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casp4P70343 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casp4P70343 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp4P70343 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp4P70343 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp4P70343 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp4P70343 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp4P70343 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp4P70343 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp4P70343 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp4P70343 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Casp4P70343 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp4P70343 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casp4P70343 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Casp4P70343 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Casp4P70343 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp4P70343 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp4P70343 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp4P70343 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms