Protein–RNA interactions for Protein: P47873

Il11, Interleukin-11, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il11P47873 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il11P47873 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il11P47873 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il11P47873 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il11P47873 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il11P47873 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il11P47873 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il11P47873 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Il11P47873 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Il11P47873 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il11P47873 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il11P47873 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Il11P47873 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Il11P47873 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Il11P47873 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Il11P47873 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Il11P47873 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Il11P47873 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Il11P47873 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Il11P47873 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Il11P47873 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Il11P47873 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il11P47873 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il11P47873 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il11P47873 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Il11P47873 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il11P47873 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il11P47873 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il11P47873 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il11P47873 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il11P47873 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il11P47873 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il11P47873 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il11P47873 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il11P47873 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il11P47873 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il11P47873 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il11P47873 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Il11P47873 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Il11P47873 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il11P47873 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il11P47873 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il11P47873 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il11P47873 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il11P47873 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il11P47873 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il11P47873 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il11P47873 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il11P47873 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il11P47873 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il11P47873 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il11P47873 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il11P47873 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il11P47873 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il11P47873 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Il11P47873 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il11P47873 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Il11P47873 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il11P47873 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Il11P47873 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Il11P47873 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Il11P47873 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Il11P47873 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Il11P47873 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il11P47873 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il11P47873 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Il11P47873 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Il11P47873 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Il11P47873 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Il11P47873 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il11P47873 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il11P47873 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il11P47873 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il11P47873 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il11P47873 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il11P47873 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Il11P47873 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Il11P47873 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Il11P47873 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Il11P47873 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Il11P47873 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Il11P47873 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Il11P47873 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Il11P47873 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Il11P47873 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Il11P47873 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Il11P47873 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Il11P47873 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Il11P47873 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Il11P47873 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Il11P47873 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Il11P47873 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Il11P47873 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Il11P47873 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Il11P47873 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Il11P47873 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Il11P47873 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Il11P47873 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Il11P47873 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Il11P47873 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms