Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mmp13P33435 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mmp13P33435 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mmp13P33435 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Mmp13P33435 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mmp13P33435 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mmp13P33435 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mmp13P33435 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mmp13P33435 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mmp13P33435 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mmp13P33435 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mmp13P33435 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mmp13P33435 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mmp13P33435 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mmp13P33435 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mmp13P33435 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mmp13P33435 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mmp13P33435 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mmp13P33435 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mmp13P33435 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp13P33435 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp13P33435 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp13P33435 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp13P33435 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mmp13P33435 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mmp13P33435 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mmp13P33435 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mmp13P33435 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mmp13P33435 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mmp13P33435 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mmp13P33435 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mmp13P33435 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mmp13P33435 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mmp13P33435 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mmp13P33435 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Mmp13P33435 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mmp13P33435 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mmp13P33435 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mmp13P33435 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mmp13P33435 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mmp13P33435 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mmp13P33435 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp13P33435 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mmp13P33435 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mmp13P33435 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp13P33435 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms