Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P20040 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P20040 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P20040 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P20040 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P20040 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P20040 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P20040 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P20040 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P20040 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P20040 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P20040 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P20040 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P20040 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P20040 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P20040 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P20040 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P20040 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P20040 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P20040 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P20040 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P20040 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P20040 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P20040 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P20040 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P20040 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P20040 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P20040 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P20040 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P20040 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P20040 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P20040 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P20040 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P20040 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P20040 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P20040 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P20040 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
P20040 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P20040 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P20040 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P20040 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P20040 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P20040 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P20040 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P20040 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P20040 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P20040 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
P20040 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P20040 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P20040 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P20040 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P20040 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P20040 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P20040 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P20040 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P20040 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P20040 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P20040 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P20040 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P20040 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P20040 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P20040 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P20040 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P20040 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P20040 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P20040 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P20040 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P20040 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P20040 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P20040 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P20040 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P20040 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P20040 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P20040 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P20040 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P20040 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P20040 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P20040 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P20040 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P20040 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P20040 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P20040 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P20040 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P20040 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P20040 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P20040 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P20040 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P20040 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P20040 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P20040 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P20040 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P20040 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms