Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnc1P19123 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnc1P19123 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnc1P19123 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnc1P19123 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnc1P19123 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnc1P19123 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnc1P19123 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnc1P19123 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnnc1P19123 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnc1P19123 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnc1P19123 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnc1P19123 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnc1P19123 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnc1P19123 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnc1P19123 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnc1P19123 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnc1P19123 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnc1P19123 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnc1P19123 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnc1P19123 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnc1P19123 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnc1P19123 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnc1P19123 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnc1P19123 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnc1P19123 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnc1P19123 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnc1P19123 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnc1P19123 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnnc1P19123 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnc1P19123 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnc1P19123 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnc1P19123 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnc1P19123 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnc1P19123 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnc1P19123 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnc1P19123 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnc1P19123 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnc1P19123 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnc1P19123 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnc1P19123 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnc1P19123 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnc1P19123 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnc1P19123 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnc1P19123 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnc1P19123 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnc1P19123 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnc1P19123 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnc1P19123 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnc1P19123 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnc1P19123 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnc1P19123 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnc1P19123 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnc1P19123 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnc1P19123 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnc1P19123 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnc1P19123 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnc1P19123 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnc1P19123 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnc1P19123 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnc1P19123 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnc1P19123 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnc1P19123 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnc1P19123 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms