Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnp1P10856 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnp1P10856 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp1P10856 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnp1P10856 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnp1P10856 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms