Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9P06683 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9P06683 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9P06683 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9P06683 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9P06683 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9P06683 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9P06683 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P06683 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P06683 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9P06683 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P06683 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9P06683 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C9P06683 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P06683 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P06683 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P06683 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9P06683 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9P06683 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9P06683 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9P06683 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9P06683 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9P06683 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9P06683 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9P06683 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9P06683 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9P06683 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9P06683 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9P06683 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C9P06683 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9P06683 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C9P06683 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9P06683 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9P06683 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9P06683 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9P06683 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C9P06683 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9P06683 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9P06683 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9P06683 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9P06683 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9P06683 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9P06683 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9P06683 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C9P06683 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9P06683 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9P06683 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9P06683 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9P06683 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9P06683 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9P06683 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9P06683 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9P06683 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9P06683 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9P06683 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9P06683 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9P06683 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9P06683 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9P06683 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9P06683 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9P06683 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C9P06683 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C9P06683 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P06683 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9P06683 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9P06683 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C9P06683 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9P06683 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P06683 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P06683 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9P06683 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P06683 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P06683 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P06683 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9P06683 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9P06683 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9P06683 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9P06683 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P06683 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9P06683 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9P06683 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9P06683 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P06683 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P06683 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P06683 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9P06683 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9P06683 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9P06683 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9P06683 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9P06683 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9P06683 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9P06683 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9P06683 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9P06683 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P06683 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P06683 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9P06683 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9P06683 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9P06683 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9P06683 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms