Protein–RNA interactions for Protein: O88735

Map7, Ensconsin, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map7O88735 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Map7O88735 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Map7O88735 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Map7O88735 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Map7O88735 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Map7O88735 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Map7O88735 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Map7O88735 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Map7O88735 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Map7O88735 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map7O88735 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Map7O88735 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Map7O88735 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Map7O88735 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Map7O88735 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Map7O88735 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Map7O88735 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Map7O88735 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Map7O88735 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Map7O88735 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Map7O88735 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Map7O88735 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Map7O88735 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map7O88735 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map7O88735 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Map7O88735 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map7O88735 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map7O88735 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map7O88735 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Map7O88735 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map7O88735 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map7O88735 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map7O88735 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Map7O88735 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map7O88735 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map7O88735 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Map7O88735 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Map7O88735 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Map7O88735 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Map7O88735 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Map7O88735 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Map7O88735 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Map7O88735 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Map7O88735 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Map7O88735 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Map7O88735 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Map7O88735 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Map7O88735 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Map7O88735 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Map7O88735 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Map7O88735 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Map7O88735 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Map7O88735 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Map7O88735 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Map7O88735 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Map7O88735 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Map7O88735 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Map7O88735 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Map7O88735 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Map7O88735 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Map7O88735 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Map7O88735 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Map7O88735 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Map7O88735 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Map7O88735 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Map7O88735 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Map7O88735 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map7O88735 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map7O88735 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map7O88735 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Map7O88735 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map7O88735 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map7O88735 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map7O88735 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map7O88735 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map7O88735 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map7O88735 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map7O88735 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Map7O88735 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Map7O88735 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Map7O88735 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map7O88735 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map7O88735 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map7O88735 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map7O88735 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map7O88735 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map7O88735 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map7O88735 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Map7O88735 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map7O88735 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map7O88735 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map7O88735 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Map7O88735 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map7O88735 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map7O88735 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map7O88735 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Map7O88735 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Map7O88735 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Map7O88735 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Map7O88735 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms