Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dll3O88516 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dll3O88516 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dll3O88516 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dll3O88516 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dll3O88516 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dll3O88516 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dll3O88516 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dll3O88516 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Dll3O88516 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dll3O88516 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dll3O88516 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dll3O88516 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Dll3O88516 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dll3O88516 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dll3O88516 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dll3O88516 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dll3O88516 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dll3O88516 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dll3O88516 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dll3O88516 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dll3O88516 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dll3O88516 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dll3O88516 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dll3O88516 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dll3O88516 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dll3O88516 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dll3O88516 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dll3O88516 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dll3O88516 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dll3O88516 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dll3O88516 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dll3O88516 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dll3O88516 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dll3O88516 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dll3O88516 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dll3O88516 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dll3O88516 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dll3O88516 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dll3O88516 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Dll3O88516 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dll3O88516 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dll3O88516 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dll3O88516 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dll3O88516 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dll3O88516 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dll3O88516 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dll3O88516 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dll3O88516 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dll3O88516 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dll3O88516 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dll3O88516 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dll3O88516 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dll3O88516 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dll3O88516 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dll3O88516 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dll3O88516 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dll3O88516 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dll3O88516 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dll3O88516 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dll3O88516 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dll3O88516 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dll3O88516 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dll3O88516 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dll3O88516 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dll3O88516 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dll3O88516 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dll3O88516 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dll3O88516 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dll3O88516 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dll3O88516 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dll3O88516 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms