Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pip4k2aO70172 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pip4k2aO70172 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pip4k2aO70172 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pip4k2aO70172 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pip4k2aO70172 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pip4k2aO70172 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pip4k2aO70172 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pip4k2aO70172 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pip4k2aO70172 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pip4k2aO70172 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pip4k2aO70172 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pip4k2aO70172 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pip4k2aO70172 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pip4k2aO70172 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pip4k2aO70172 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pip4k2aO70172 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pip4k2aO70172 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pip4k2aO70172 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pip4k2aO70172 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pip4k2aO70172 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pip4k2aO70172 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pip4k2aO70172 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pip4k2aO70172 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pip4k2aO70172 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pip4k2aO70172 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pip4k2aO70172 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pip4k2aO70172 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pip4k2aO70172 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pip4k2aO70172 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pip4k2aO70172 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pip4k2aO70172 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pip4k2aO70172 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pip4k2aO70172 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pip4k2aO70172 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pip4k2aO70172 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pip4k2aO70172 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pip4k2aO70172 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pip4k2aO70172 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pip4k2aO70172 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pip4k2aO70172 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pip4k2aO70172 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pip4k2aO70172 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pip4k2aO70172 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pip4k2aO70172 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pip4k2aO70172 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pip4k2aO70172 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pip4k2aO70172 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pip4k2aO70172 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pip4k2aO70172 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pip4k2aO70172 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pip4k2aO70172 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pip4k2aO70172 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pip4k2aO70172 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pip4k2aO70172 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms