Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcns1O35173 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcns1O35173 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcns1O35173 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcns1O35173 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcns1O35173 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcns1O35173 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcns1O35173 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcns1O35173 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcns1O35173 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcns1O35173 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcns1O35173 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcns1O35173 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcns1O35173 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcns1O35173 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcns1O35173 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcns1O35173 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcns1O35173 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcns1O35173 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcns1O35173 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcns1O35173 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcns1O35173 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcns1O35173 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms