Protein–RNA interactions for Protein: B7ZCM9

Gm28042, Phospholipase A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28042B7ZCM9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm28042B7ZCM9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm28042B7ZCM9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm28042B7ZCM9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm28042B7ZCM9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm28042B7ZCM9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm28042B7ZCM9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm28042B7ZCM9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28042B7ZCM9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm28042B7ZCM9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm28042B7ZCM9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm28042B7ZCM9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm28042B7ZCM9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm28042B7ZCM9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm28042B7ZCM9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm28042B7ZCM9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm28042B7ZCM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm28042B7ZCM9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm28042B7ZCM9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm28042B7ZCM9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm28042B7ZCM9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm28042B7ZCM9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm28042B7ZCM9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm28042B7ZCM9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm28042B7ZCM9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm28042B7ZCM9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm28042B7ZCM9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm28042B7ZCM9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm28042B7ZCM9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm28042B7ZCM9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm28042B7ZCM9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm28042B7ZCM9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm28042B7ZCM9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm28042B7ZCM9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm28042B7ZCM9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm28042B7ZCM9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28042B7ZCM9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm28042B7ZCM9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm28042B7ZCM9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm28042B7ZCM9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm28042B7ZCM9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gm28042B7ZCM9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28042B7ZCM9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28042B7ZCM9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms