Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usf3B2RUQ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usf3B2RUQ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usf3B2RUQ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usf3B2RUQ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usf3B2RUQ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usf3B2RUQ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usf3B2RUQ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usf3B2RUQ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usf3B2RUQ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usf3B2RUQ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usf3B2RUQ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usf3B2RUQ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usf3B2RUQ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usf3B2RUQ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usf3B2RUQ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usf3B2RUQ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usf3B2RUQ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usf3B2RUQ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usf3B2RUQ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usf3B2RUQ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usf3B2RUQ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usf3B2RUQ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usf3B2RUQ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usf3B2RUQ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usf3B2RUQ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usf3B2RUQ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usf3B2RUQ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usf3B2RUQ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usf3B2RUQ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usf3B2RUQ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usf3B2RUQ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usf3B2RUQ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usf3B2RUQ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usf3B2RUQ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usf3B2RUQ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usf3B2RUQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usf3B2RUQ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usf3B2RUQ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usf3B2RUQ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usf3B2RUQ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usf3B2RUQ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usf3B2RUQ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usf3B2RUQ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usf3B2RUQ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usf3B2RUQ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usf3B2RUQ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms