Protein–RNA interactions for Protein: A2RRY9

4930595M18Rik, RIKEN cDNA 4930595M18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595M18RikA2RRY9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930595M18RikA2RRY9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930595M18RikA2RRY9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
4930595M18RikA2RRY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930595M18RikA2RRY9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930595M18RikA2RRY9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930595M18RikA2RRY9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930595M18RikA2RRY9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930595M18RikA2RRY9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930595M18RikA2RRY9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930595M18RikA2RRY9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930595M18RikA2RRY9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930595M18RikA2RRY9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930595M18RikA2RRY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930595M18RikA2RRY9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
4930595M18RikA2RRY9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930595M18RikA2RRY9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930595M18RikA2RRY9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
4930595M18RikA2RRY9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930595M18RikA2RRY9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
4930595M18RikA2RRY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
4930595M18RikA2RRY9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930595M18RikA2RRY9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930595M18RikA2RRY9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930595M18RikA2RRY9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930595M18RikA2RRY9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930595M18RikA2RRY9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930595M18RikA2RRY9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930595M18RikA2RRY9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930595M18RikA2RRY9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930595M18RikA2RRY9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
4930595M18RikA2RRY9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930595M18RikA2RRY9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930595M18RikA2RRY9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930595M18RikA2RRY9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
4930595M18RikA2RRY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
4930595M18RikA2RRY9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930595M18RikA2RRY9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930595M18RikA2RRY9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930595M18RikA2RRY9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930595M18RikA2RRY9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930595M18RikA2RRY9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930595M18RikA2RRY9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930595M18RikA2RRY9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930595M18RikA2RRY9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930595M18RikA2RRY9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930595M18RikA2RRY9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930595M18RikA2RRY9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930595M18RikA2RRY9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930595M18RikA2RRY9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930595M18RikA2RRY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930595M18RikA2RRY9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930595M18RikA2RRY9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930595M18RikA2RRY9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms