Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga8A2ARA8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga8A2ARA8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga8A2ARA8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga8A2ARA8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga8A2ARA8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga8A2ARA8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga8A2ARA8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga8A2ARA8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga8A2ARA8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga8A2ARA8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga8A2ARA8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga8A2ARA8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga8A2ARA8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga8A2ARA8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga8A2ARA8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga8A2ARA8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga8A2ARA8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga8A2ARA8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itga8A2ARA8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itga8A2ARA8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itga8A2ARA8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itga8A2ARA8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Itga8A2ARA8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga8A2ARA8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga8A2ARA8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga8A2ARA8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga8A2ARA8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga8A2ARA8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga8A2ARA8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga8A2ARA8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga8A2ARA8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga8A2ARA8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga8A2ARA8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga8A2ARA8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga8A2ARA8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga8A2ARA8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga8A2ARA8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga8A2ARA8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga8A2ARA8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga8A2ARA8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga8A2ARA8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms