Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2l1A2A259 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2l1A2A259 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2l1A2A259 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2l1A2A259 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2l1A2A259 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2l1A2A259 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2l1A2A259 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2l1A2A259 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkd2l1A2A259 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2l1A2A259 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2l1A2A259 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l1A2A259 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2l1A2A259 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2l1A2A259 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2l1A2A259 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2l1A2A259 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2l1A2A259 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2l1A2A259 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2l1A2A259 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2l1A2A259 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2l1A2A259 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2l1A2A259 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2l1A2A259 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2l1A2A259 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2l1A2A259 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l1A2A259 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l1A2A259 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l1A2A259 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2l1A2A259 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l1A2A259 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l1A2A259 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2l1A2A259 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pkd2l1A2A259 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l1A2A259 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l1A2A259 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2l1A2A259 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2l1A2A259 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2l1A2A259 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2l1A2A259 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2l1A2A259 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkd2l1A2A259 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2l1A2A259 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkd2l1A2A259 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms