Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q4

Ighv5-12, Immunoglobulin heavy variable 5-12 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-12A0A075B5Q4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ighv5-12A0A075B5Q4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv5-12A0A075B5Q4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ighv5-12A0A075B5Q4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv5-12A0A075B5Q4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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Ighv5-12A0A075B5Q4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Ighv5-12A0A075B5Q4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Ighv5-12A0A075B5Q4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv5-12A0A075B5Q4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Ighv5-12A0A075B5Q4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Ighv5-12A0A075B5Q4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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