Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arcn1Q5XJY5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Arcn1Q5XJY5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Arcn1Q5XJY5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Arcn1Q5XJY5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Arcn1Q5XJY5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arcn1Q5XJY5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arcn1Q5XJY5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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